Если продавец выставил счет-фактуру на бумаге, то второй экземпляр он должен хранить в таком же виде.
Электронный документ в этом случае не подойдет, даже если заверен квалифицированной электронной подписью руководителя либо иного уполномоченного лица. Такой порядок не предусмотрен ни НК РФ, ни Правилами заполнения счета-фактуры, пояснило ведомство.
Документ: Письмо Минфина России от 30.05.2017 N 03-07-09/33048.
Источник: КонсультантПлюс